sgrna生信分析
DNA測序的發展及其大規模應用促進了精準醫療、個性化用藥的發展。通過測序技術可在細胞之間比較某個基因的突變狀態,但通常會有許多其它混雜的特征信息掩蓋基因型和疾病類型之間的直接關系。近年來,隨著CRISPR-Cas9基因編輯技術的成熟與普及,研究人員可以編輯活體細胞基因組,精確地改變DNA序列,最終為開發出人類遺傳疾病的新療法奠定基礎。

泓迅科技針對CRISPR-Cas9基因編輯技術,提供專業的sgRNA生物信息學服務。通過sgRNA序列設計,人工合成并成功進行基因敲除后,對測序結果進行基因表達譜分析、染色體DNA拷貝數統計等,最終實現從sgRNA設計、合成到功能分析的一體化服務。

泓迅科技擁有成熟一流的DNA合成技術和經驗豐富的生物信息工程師,可根據客戶具體需求,定制生物信息學數據分析服務。我們能夠結合PRECOG、TCGA以及COSMIC等專業數據庫,分析篩選基因表達高低信息、基因突變頻率信息、預臨床后相關性數據,進行整合性生物基因組學分析,為潛在藥物靶點和個性化醫療提供解決方案。同時,還可以輔助研究人員找到其它可以作為治療性靶點的附加基因。

sgRNA一體化服務流程:

服務優勢:

1.豐富的CRISPR-Cas9 sgRNA設計經驗,覆蓋13種模式物種,可針對具體需求個性化設計。
2.專業的生物信息學服務團隊,科學的方案設計,深入的數據挖掘,安全靈活的數據報告呈遞方式。

應用領域:

農業、微生物、環境學、海洋學、人體微生態等

泓迅案例:

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    用攜帶sgRNA的CRISPR-Cas9文庫病毒感染細胞,對經過文庫篩選后不同時期的細胞基因組進行二代測序。首先對sgRNA進行敲除效果評價,其次通過分析、比較,獲得被富集或缺失的基因,進行GO,KEGG等功能注釋,從而篩選出對細胞生存或者藥物作用所必需的基因和靶點,最后結合已有的癌癥數據庫、突變數據庫等信息,對靶點的信息進一步分析。

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    sgRNA的基因敲除效果評價 sgRNA敲除后對基因表達的影響
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    sgRNA敲除后對信號通路的影響
    與TCGA數據庫的數據結合,挖掘潛在藥物靶點

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